驻藏大臣，是藏军的领袖。他的幕僚有一位驻藏大臣帮办，两名老爷，和一名军需官(藏语称颇本)。此外还有一名藏族将军(称为麻本)，六名代本(团长)，六名如本(营长)以及若干下级军官。
驻藏大臣是西藏地方政府与朝廷之间一切联系的中介人物。他调解西藏各邦与拉萨政府之间的纠纷;他给当地军官授衔和荣誉称号，但从理论上说，他无权干预当地内部事务。他平时驻锡拉萨，每年往定日宗视察尼泊尔边境的事务。有时驻藏大臣帮办代替他履行这一职责，他则去往各宗视察军需和部队。
现在西藏和清廷的政治关系极为密切，18世纪头二三十年间在拉萨建立的驻藏大臣制度已把西藏从清朝的保护国变成清朝的藩属了。两位驻藏大臣是地方军队的司令，因此越权取得当地最高政治权力。任命两名驻藏大臣处理当地事务，可能是基于让他们两人互相暗中监督这一原则。跟在中国内地一样，这已成为西藏的惯例。
藏人从心底害怕驻藏大臣。每当驻藏大臣外出游玩或进行视察，穷苦的村民都被迫无偿地为他和他的随从提供饮食、交通工其，以及各种劳务。他们还要提供马匹和耗牛，由于驻藏大臣随从众多，毫不爱护牲畜，致使牲畜途中大量死亡。他们的损失得不到补偿，由喇嘛们主持的法庭不受理对这类压迫的申诉。驻藏大臣外出时，村民的糟把和羊也被强行夺走，村民忍受不了这种压迫，往往群起反抗驻藏大臣的随从跟斑，这时当地的宗本就出面调解，但宗本一般都是驻藏大臣提拔的。事情还不仅如此，每个进西藏的汉族和满族士兵或商人，无论是为公事还是私事，都有北京签发的路条，有了这路条，途中就能得到很大的方便，并可安全地、无偿地到达目的地。离开西藏回汉地的人也有此待遇，唯有驻藏大臣才有资格签发路条。愉快的旅行者有了驻藏大臣的授权，抓住每个机会利用他的路条，当村民不立即满足他的要求时，他是决不会不使用他的马鞭的。
驻藏大臣每年至少要去拜望扎什喇嘛(班禅)一次，与他商讨国家大事。这时，他作为清朝皇帝的代表，受到最高规格的接待。他双手合十鞠躬致意，走近法座，向扎什喇嘛献一哈达。扎什喇嘛则伸手为他摸顶祝福，然后请他坐在右边的坐垫上。互相简短问候以后，话题就转到皇帝的健康、人民百姓的幸福，以及当年收成的前景上来。蒙文、满文和汉文的译员总陪伴着驻藏大臣，扎什喇嘛也有他自己的译员。驻藏大臣在外面时总是坐一黄色轿子，有许多雇从伺候，有的拿着他的官衔标徽。
至于代本，两名驻守拉萨，两名在日喀则，一名在江孜，还有一名在定日宗。六名如本，三名在前藏，三名在后藏。正规军6000人，其中3000人现役，另3000人在家拿半薪。现役士兵每月薪水2两银子，服役期3年。期满后回家，加人地方部队(藏语称隅玛)，此后他们可能随时被招回现役部队。他们一般不穿制服，不过有些人穿汉式短上衣。他们的武器有火绳枪、弓箭、长矛和投石器。
除了正规军以外，西藏地方政府可以在必要时从各地征召人员人伍。每个家庭必须派出一人，带上自用的武器和粮食;每个地主为其拥有的每一冈土地派出一人当兵，另派一人为他背粮食。噶伦、宗本、代本和头人为骑兵(藏语称达马)提供士兵，有马匹的人都属于骑兵。
除了维持部队的开销以外(每名清兵月薪是14个卢比和30苏〔sur]糟把，每名藏族士兵的是2.25卢比)，西藏地方政府还必须为驻藏大臣的办公处支付5万卢比，驻藏大臣的薪水另付。
西藏地方政府以及整个民族都在这种过多的但又毫无用处的开销的重压下呻吟;但上面宣布，为了保护神圣喇嘛们不受英国、尼泊尔、克什米尔政府的侵犯，这种做法是必要的。这后两个国家是西藏的盟国，一提到英国这个名字，就令政府官员，特别是僧官害怕。他们认为它是不可战胜的力量，是不断与天神打仗的拉玛因(巨人)的化身。
藏人普遍相信，200年以后，扎什喇嘛将隐退香巴拉(佛教徒的乌托邦城市)，不再回到西藏，整个世界在此期间将受制于披楞人(俄国人和英国人)。无论是清朝皇帝还是天神和住在金色须弥山周围的神人组成的联合军团都无法阻止他们的武装进攻或抗拒他们超凡的智惹。藏人的政策是与他们保持距离，不是公开对抗，而是用权谋跟他们周旋。教他们采用这政策的是驻藏大臣，为了使西藏不受外国侵略，他总是忙于想出新招。

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