珠穆朗玛峰自然保护区内有一些国家级和世界级的珍稀物种和一定数量的独特的生态系统，但由于过度放牧，无节制的砍伐森林和灌木等滋用自然资源现象.一些物种和生态系统已濒临灭绝。
旅游业在该地区的发展可能对自然植物造成这祥的破坏:
1.牲畜
运货耗牛和编牛拖运徒步旅游者和登山设备是当地村民从旅游业中赚取收入的主要方式.但耗牛在高海拔草场吃草，减少了该地区受保护的大型野生动物的食料供给。
2.木材燃料的使用
徒步旅游者和登山者消费了过量的材料嫉烧煮饭和烧水.赶耗牛的人通常用木本植物煮饭和取暖.众多的家庭旅馆的木材燃烧量也大大超过普通家庭，这些都对整个珠穆朗玛峰自然保护区的森林造成破坏。
3.家庭旅馆和公共设施理筑中的木材使用
为保护传统的西藏建筑外观和功能，延续传统建筑技巧，木材的使用是必要的。西藏式样的建筑虽然不需要大盆的木材，但相当数量的巨梁取材于当地森林。
4. 道路
载有旅游者和设备的车辆有时随惫穿越草地或从公路外截道下坡.损坏了高海拔地区生长的植物。土块加固道路移去了土壤上部的保护层.使下层土坡遭受风和水的侵蚀。缺乏良好排水渠道的公路，易受雨水侵蚀.造成恶劣路况及高维护成本。
把废弃物置于水源附近会严重污染水质，危及沿河人类及野生动物的健康，建议建立固定厕所和其他必备设施，限制排泄物对环境特别是水质的污染。肥皂、煤油、汽油及其他营地遗留物也给水质造成威胁。
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